Cuando la afección se presenta durante el embarazo puede continuarse con el tratamiento habitual.
La menstruación y el uso de anticonceptivos orales no influyen sobre las características de la cefalea en racimo. En cambio, el embarazo y la menopausia provocan un aumento importante de la gravedad del cuadro.
La única terapia permitida durante el embarazo es la inhalación de oxígeno al 100%, que resulta efectiva sólo en 70% de los casos.
La menstruación, el uso de anticonceptivos orales, el embarazo y la menopausia tienen una influencia muy importante sobre las características de la cefalea en racimo.