Conceptos Categóricos

Crónicas de autores

Gilberto Vaughan *

Autor invitado por SIIC

El trabajo describe la identificación de la transmisión del VHC mediante secuenciación de segunda generación en individuos que informan consumo de drogas

IDENTIFICACION DE LA TRANSMISION DEL VIRUS DE LA HEPATITIS C MEDIANTE EL USO DE UNA PLATAFORMA DE SECUENCIACION DE SEGUNDA GENERACION

El uso de plataformas de secuenciación de segunda generación facilita la identificación de la transmisión del VHC en casos aparentemente no relacionados

*Gilberto Vaughan
describe para SIIC los aspectos relevantes de su trabajo
IDENTIFICATION OF HEPATITIS C VIRUS TRANSMISSION USING A NEXT GENERATION SEQUENCING APPROACH
Journal of Clinical Microbiology,
50(4):1461-1463

Esta revista, clasificada por SIIC Data Bases, integra el acervo bibliográfico
de la Biblioteca Biomédica (BB) SIIC.

Institución principal de la investigación
*Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos, Secretaría de Salud, Ciudad de México , México., Ciudad De México, México
Descripción de la investigación
Ciudad De México, México (especial para SIIC)
Ciudad de México, México (especial para SIIC) Se ha estimado que aproximadamente 130 millones de personas están actualmente infectadas por el virus de la hepatitis C (VHC). Más aun, anualmente, se producen unos 3 millones de infecciones a nivel mundial. Los factores de riesgo más importantes para la adquisición de la infección por este virus son el uso de drogas inyectables, transfusiones sanguíneas (antes de la implementación de los métodos de detección en bancos de sangre), y transmisiones en nosocomios. El uso de drogas ha sido reconocido como el medio de transmisión más importante. Sin embargo, en México, este modo de transmisión no ha sido informado como el factor de riesgo más asociado con la transmisión de VHC. Esto es probablemente debido a diferentes razones, las cuales incluyen la identificación oportuna de las redes de transmisión entre grupos de alto riesgo y la dificultad de la detección de casos durante la fase aguda de la infección. Aunado a esto, los tiempos tan prolongados requeridos para la manifestación de la infección por este virus dificultan aun más el establecimiento de la fuente original. Los métodos disponibles para la identificación de focos de transmisión resultan ser caros y laboriosos, por lo cual sólo suelen están disponibles en laboratorios de referencia y centros de investigación. El uso de métodos de secuenciación de segunda generación es una alternativa a las plataformas actuales par la identificación de núcleos de transmisión. En este trabajo, nosotros identificamos un foco de transmisión involucrando individuos que informaron el uso de drogas inyectables. Estos individuos formaban parte de un estudio mayor relacionado con el uso de la terapia antiviral en pacientes infectados por el VHC genotipo 1. Los pacientes eran negativos para hepatitis B y para el virus de la inmunodeficiencia humana. Para analizar la composición de la población viral intrahospedero en estos pacientes se utilizó el método de amplicon sequencing, empleando la plataforma del Genome Sequencer de Roche. La región analizada fue la región hipervariable 1 del virus. El análisis filogenético de las secuencias obtenidas de ocho pacientes diferentes demostró que dos pacientes, los individuos A y B, compartían algunas de las variantes virales. Las distancias genéticas entre los dos pacientes fueron 0.0-0.041, las cuales fueron considerablemente menores que las observadas entre casos no relacionados (0.2). Una entrevista con ambos pacientes demostró que los dos sujetos estaban relacionados y pertenecían a un mismo foco de infección. Sin embargo, los individuos no informaron el intercambio de jeringas, transfusión sanguínea o contacto sexual. El uso de drogas en México no ha sido reconocido como el principal factor de riesgo para la adquisición de la infección por el VHC. A pesar de ello, el uso de drogas inyectables en el país es un problema creciente. Esto podría significar que en un futuro cercano el uso de drogas pase a ser el factor número uno para la transmisión del VHC. Es por ello que la identificación de los núcleos de infección entre grupos de alto riesgo es de gran importancia para la detección y tratamiento de casos. Es importante mencionar que las guías de tratamiento actuales no excluyen a los usuarios de drogas inyectables, ya que estos individuos muestran respuesta a la terapia antiviral tan alta como los pacientes que no son consumidores de drogas. Más aun, estudios del modelaje de la infección sugieren que aun proporciones pequeñas de tratamiento entre individuos que informan el consumo de drogas tienen consecuencias importantes en el control de la infección. En conclusión, los métodos de secuenciación de segunda generación son muy poderosos y permiten el análisis en detalle de la población viral intrahospedero, lo cual, a su vez, facilita la identificación de casos aparentemente no relacionados. Los rápidos avances en la implementación de dichas plataformas y métodos para el manejo de datos hacen que el uso de métodos de segunda y tercera generación sea visto como una alternativa viable a los métodos convencionales para el estudio de brotes debidos a la infección por el VHC.
Acerca del trabajo completo
IDENTIFICATION OF HEPATITIS C VIRUS TRANSMISSION USING A NEXT GENERATION SEQUENCING APPROACH

Título original en castellano
IDENTIFICACION DE TRANSMISION DEL VIRUS DE LA HEPATITIS C MEDIANTE EL USO DE UNA PLATAFORMA DE SECUENCIACION DE SEGUNDA GENERACION

Autores
Gilberto Vaughan1, Mauricio Vazquez Pichardo2, Mayra Cruz Rivera3, Pilar Rivera Osorio4, Juan Carlos Carpio Pedroza5, Juan Alberto Ruíz Pacheco6, Karina Ruiz Tovar7, Alejandro Escobar Gutiérrez8, Gilberto Vaughan9
1 Virólogo, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos, Secretaría de Salud, Ciudad de México , México., Ciudad De México, México, Jefe de Departamento
2 Doctor en Ciencias, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico, Jefe de Laboratorio
3 Maestra en Ciencias, Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autónoma de México, Mexico City, Mexico, Jefa de Laboratorio
4 Maestra en Ciencias, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico, Jefe de Laboratorio
5 Doctor en Ciencias, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico, Jefe de Laboratorio
6 Maestro en Ciencias, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico
7 Maestra en Ciencias, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico, Jefe de Lboratorio
8 Doctor en Ciencias, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico, Jefe de Departamento
9 Doctor en Ciencias, Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos, Secretaría de Salud, Mexico City, Mexico, Jefe de Departamento

Acceso a la fuente original
Journal of Clinical Microbiology
http://jcm.asm.org
Acceso al texto original completo (full text)
http://jcm.asm.org/content/50/4/1461.long
Acceso al resumen/abstract original
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22301026
El artículo se relaciona estrictamente con las especialidades de siicsalud

 Principal 1


 Principal 2

El artículo se conecta secundariamente con las especialidades
    
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Para comunicarse con Gilberto Vaughan mencionar a SIIC como referencia:
gilvaughan@yahoo.com
Autor invitado
31 de mayo, 2012
Descripción aprobada
12 de julio, 2012
Reedición siicsalud
7 de junio, 2021
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